"Хаосом" называется материя, еще не имеющая фиксированности на каком-либо Царстве (животном, минеральном или растительном). Соответственно, при дальнейшей работе, она и становится тем основанием, дающем Философский Камень.
Отсюда можно предположить два пути:
первый - следует обратить или как говорили алхимики "редуцировать" материю в свое первичное состояние (то есть "хаос");
второй - обнаружить этот самый "хаос" и очистить его.

Наука достигла определенных вершин, и это большой плюс, но не следует рассматривать алхимию в рамках существующей научной парадигмы (научного мнения). Как вы понимаете, все же есть разделение между химией и алхимией, что неизбежно приводит к различному пониманию терминов и общей теории. Соответственно, если у вас есть желание продвигаться по "альтернативной химии" (алхимии), то вам следует понемногу избавляться от современных научных предположений о строении материи. Чтение алхимических трактатов, опыты и их интерпретация, согласно герметическому знанию, понемногу будут вам способствовать в овладении Искусством, и в конце концов, вы придете к поставленной цели. Но, если вы будете "скакать на двух конях", то результат будет плачевный, так как "нельзя служить двум Богам одновременно".
Поэтому, вы сами для себя первоначально должны решить, следует ли вам идти по пути Искусства, дабы в последствии не погружаться в пучину тоски и отчаяния.

Александр (Входящий) прав - алхимический "хаос", это вода, жидкость. Почему и многие Адепты, прямо намекали на работу с материями из которых проще выделить эту "воду"; минералы в их перечень не входили.
Конечно, при достижении определенных успехов и навыков, "воду" можно выделить и из марказита, пирита, сурьмы, витриола и прочих веществ, но сие, очень и очень трудоемко и требует лабораторной дисциплины и соответствующих сосудов.